Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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