Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms