Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMNQ96JQ2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms