Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms