Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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LIN37Q96GY3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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LIN37Q96GY3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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LIN37Q96GY3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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LIN37Q96GY3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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LIN37Q96GY3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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