Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP33Q8TEY7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP33Q8TEY7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms