Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT2Q8N9I0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms