Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
STRCQ7RTU9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCQ7RTU9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms