Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms