Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms