Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

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Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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