Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

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Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1EQ15878 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1EQ15878 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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