Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms