Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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