Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL1Q13616 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CUL1Q13616 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
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