Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAMK2BQ13554 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CAMK2BQ13554 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2BQ13554 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2BQ13554 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2BQ13554 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2BQ13554 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2BQ13554 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2BQ13554 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2BQ13554 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2BQ13554 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2BQ13554 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2BQ13554 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms