Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLD1Q13393 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLD1Q13393 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLD1Q13393 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLD1Q13393 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLD1Q13393 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLD1Q13393 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLD1Q13393 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLD1Q13393 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLD1Q13393 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLD1Q13393 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PLD1Q13393 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLD1Q13393 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLD1Q13393 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PLD1Q13393 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PLD1Q13393 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PLD1Q13393 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLD1Q13393 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms