Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLF1Q13351 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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