Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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TRAF1Q13077 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
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TRAF1Q13077 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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