Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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