Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC25A11Q02978 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms