Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A2Q01362 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms