Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL3P58872 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms