Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB38P57729 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB38P57729 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB38P57729 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB38P57729 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB38P57729 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB38P57729 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB38P57729 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB38P57729 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB38P57729 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB38P57729 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms