Protein–RNA interactions for Protein: P55316

FOXG1, Forkhead box protein G1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXG1P55316 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms