Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATN1P54259 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATN1P54259 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATN1P54259 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATN1P54259 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATN1P54259 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATN1P54259 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATN1P54259 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATN1P54259 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATN1P54259 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATN1P54259 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATN1P54259 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATN1P54259 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATN1P54259 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATN1P54259 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATN1P54259 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATN1P54259 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATN1P54259 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATN1P54259 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATN1P54259 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATN1P54259 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATN1P54259 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms