Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPAP53621 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPAP53621 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPAP53621 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COPAP53621 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPAP53621 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPAP53621 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPAP53621 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPAP53621 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COPAP53621 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPAP53621 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPAP53621 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPAP53621 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPAP53621 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPAP53621 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPAP53621 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPAP53621 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPAP53621 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPAP53621 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPAP53621 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPAP53621 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPAP53621 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPAP53621 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms