Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP98P52948 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP98P52948 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP98P52948 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP98P52948 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP98P52948 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP98P52948 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP98P52948 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP98P52948 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP98P52948 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP98P52948 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP98P52948 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP98P52948 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP98P52948 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP98P52948 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP98P52948 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUP98P52948 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUP98P52948 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUP98P52948 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUP98P52948 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP98P52948 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP98P52948 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP98P52948 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP98P52948 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP98P52948 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP98P52948 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP98P52948 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP98P52948 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP98P52948 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP98P52948 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP98P52948 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP98P52948 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP98P52948 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP98P52948 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP98P52948 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP98P52948 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP98P52948 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP98P52948 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP98P52948 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP98P52948 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP98P52948 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP98P52948 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP98P52948 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP98P52948 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP98P52948 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP98P52948 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP98P52948 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP98P52948 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP98P52948 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP98P52948 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP98P52948 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP98P52948 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP98P52948 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms