Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
THOP1P52888 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
THOP1P52888 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
THOP1P52888 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
THOP1P52888 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
THOP1P52888 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
THOP1P52888 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
THOP1P52888 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
THOP1P52888 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
THOP1P52888 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THOP1P52888 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THOP1P52888 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THOP1P52888 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THOP1P52888 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THOP1P52888 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THOP1P52888 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THOP1P52888 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THOP1P52888 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THOP1P52888 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THOP1P52888 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THOP1P52888 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THOP1P52888 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THOP1P52888 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THOP1P52888 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THOP1P52888 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THOP1P52888 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THOP1P52888 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
THOP1P52888 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THOP1P52888 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THOP1P52888 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms