Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms