Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATA4P43694 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA4P43694 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA4P43694 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA4P43694 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA4P43694 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms