Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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