Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPS1P31327 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPS1P31327 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CPS1P31327 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPS1P31327 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPS1P31327 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPS1P31327 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPS1P31327 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPS1P31327 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CPS1P31327 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPS1P31327 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPS1P31327 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPS1P31327 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPS1P31327 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPS1P31327 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPS1P31327 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPS1P31327 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPS1P31327 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPS1P31327 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPS1P31327 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPS1P31327 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CPS1P31327 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPS1P31327 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPS1P31327 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPS1P31327 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CPS1P31327 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPS1P31327 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPS1P31327 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPS1P31327 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPS1P31327 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPS1P31327 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPS1P31327 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPS1P31327 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPS1P31327 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPS1P31327 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CPS1P31327 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPS1P31327 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPS1P31327 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPS1P31327 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPS1P31327 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPS1P31327 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPS1P31327 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPS1P31327 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPS1P31327 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPS1P31327 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPS1P31327 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPS1P31327 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPS1P31327 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPS1P31327 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPS1P31327 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPS1P31327 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPS1P31327 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPS1P31327 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPS1P31327 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPS1P31327 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms