Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms