Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms