Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms