Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD3P0DMS9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms