Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PKHD1P08F94 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PKHD1P08F94 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PKHD1P08F94 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PKHD1P08F94 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PKHD1P08F94 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PKHD1P08F94 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PKHD1P08F94 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PKHD1P08F94 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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