Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms