Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
E9PCH4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
E9PCH4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
E9PCH4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
E9PCH4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
E9PCH4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
E9PCH4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
E9PCH4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
E9PCH4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
E9PCH4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
E9PCH4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms