Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E9PCH4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E9PCH4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
E9PCH4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E9PCH4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
E9PCH4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
E9PCH4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
E9PCH4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
E9PCH4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
E9PCH4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
E9PCH4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
E9PCH4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
E9PCH4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
E9PCH4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
E9PCH4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
E9PCH4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms