Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM200CA6NKL6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms