Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms