Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms