Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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HCN4Q9Y3Q4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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HCN4Q9Y3Q4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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HCN4Q9Y3Q4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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HCN4Q9Y3Q4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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HCN4Q9Y3Q4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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HCN4Q9Y3Q4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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HCN4Q9Y3Q4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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HCN4Q9Y3Q4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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HCN4Q9Y3Q4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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HCN4Q9Y3Q4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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HCN4Q9Y3Q4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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