Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FZD1Q9UP38 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FZD1Q9UP38 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FZD1Q9UP38 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FZD1Q9UP38 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FZD1Q9UP38 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FZD1Q9UP38 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FZD1Q9UP38 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms