Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms