Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms