Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MLH3Q9UHC1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms