Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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