Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN1Q9BY11 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN1Q9BY11 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms